Ancaman terbesar bagi kehidupan kura-kura duri adalah manusia. Manusia menjadikan kura-kura duri sebagai hewan peliharaan, mengambil hewan-hewan ini dari habitat aslinya, juga menjualnya sebagai hewan peliharaan atau daging eksotis.
Kura-kura duri telah menyandang status Endangered (Terancam) dalam daftar merah IUCN dan masuk daftar Appendix II oleh CITES. Populasi di habitat aslinya semakin berkurang tetapi jumlahnya belum diketahui secara pasti. Penurunan populasinya disebabkan oleh berkurangnya daerah hunian, serta maraknya perburuan dan perdagangan liar.
